Если на дне или в береговой зоне водоема бьют родники или ключи, то места выхода их на поверхность следует очищать от ила, грязи и растительности. Дно в этих местах покрывают галькой или песком, насыпая их слоем 2-3 см, а края участка укрепляют кирпичной кладкой. На берегу у выхода на поверхность грунтовых вод прерывают водосборную канаву, направляя стекающую воду в пруд. Необходимо вести постоянную борьбу с загрязнением водоемов, ибо загрязнение прудов, попадание в них ядовитых веществ и болезнетворных микроорганизмов могут привести к гибели рыбы.

На берегах водоемов запрещается хранить химические и ядовитые вещества. В рыбоводных прудах нельзя замачивать лен, коноплю, кожу и другое сырье, сбрасывать в воду или оставлять на берегу грунт, выбранный при дноуглубительных и дноочистительных работах, кору, сучья, щепу, опилки или другие отходы древесины, хозяйственный мусор и т. п. Необходимо препятствовать попаданию в рыбоводные пруды сточных вод и различных отходов промышленных и коммунальных предприятий.